Инфраструктура

На данный момент ЦОД СГК ИЦиГ СО РАН имеет в своем составе:

Вычислительные SMP сервера:

  1. Сервер Supermicro AS-2042G-6RF (2014г) [ 4 x AMD Opteron(tm) Processor 6278; 1Tb DDR3; 5 x 4Tb SAS HDD; 1Tb SATA HDD; 2 x 1GbE; 2 x 10GbE];
  2. Сервер Dell PowerEdge 730dx (2016г) [ 2 x Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v4 @ 2.60GHz; 1Tb DDR4; 4 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 1Tb HDD ; 4 x 6Tb HDD; 2 x 446Gb SSD ]
  3. Сервер высокой плотности Huawei XH620 (2018г)[2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb DDR4; 2 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 300GBx2 HDD]
  4. Сервер высокой плотности Huawei XH620 (2018г)[2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb DDR4; 2 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 300GBx2 HDD]
  5. Сервер высокой плотности Huawei XH620 (2018г)[2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb DDR4; 2 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 300GBx2 HDD]
  6. Сервер высокой плотности Huawei XH620 (2018г)[2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb DDR4; 2 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 300GBx2 HDD]
  7. Сервер РСК Бриз RSC BS R208 (2019г): 2 x Intel Xeon Platinum 8268 (2,9 GHz, 24c, DDR4, 205 W), 12 x 32Gb DDR4 ECC Reg, 4 x 4Tb NVMe SSD Intel P4510, 2 x 375Gb NVMe SSD Intel Optane DC P4800X, лицензия IMDT 2 шт., 10 Gigabit Ethernet 2 порта SFP+

Система хранения:

  1. Дисковая полка Etegro Fastor JS300 G3 (2014г) [ 60x 4Tb SAS HDD ]; управляющий сервер Etegro RS 130 G4. Общий объем доступного дискового пространства – 144Тб.
  2. Дисковая полка Huawei OceanStor 2200 V3 (2017г) Общий объем доступного дискового пространства 143 Тб.
  3. Дисковая полка Huawei OceanStor 5300 V3 (2017г) Общий объем доступного дискового пространства 20Тб.
  4. Дисковая полка HP D2700 (2010г) Общий объем доступного дискового пространства – 8Тб.
  5. Ленточная система хранения HP MSL 4048 (2010г) — общий объем 46 кассет по 1Тб .
  6. Система хранения данных AERODISK Engine N4, Двухконтроллерная, (FC/iSCSI/NFS/SMB, SAS BE, Thin Provisioning, Compression, Snap/Clone, Autosupport). Общий объем доступного пространства 440Тб.

Система виртуализации на базе XCP-NG Xen Server в составе:

  1. Сервер HP DL 380 G6 (2 х Intel 5580; 198Gb RAM ) (2010г)
  2. Сервер HP DL 360 G6 (2 х Intel 5560; 198Gb RAM ) (2010г)
  3. Сервер HP DL 360 G6 (2 х Intel 5560; 48Gb RAM ) (2010г)
  4. Сервер Huawei XH620 [ 2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 256Gb RAM ] (2017г)
  5. Сервер Huawei XH620 [ 2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 256Gb RAM ] (2017г)
  6. Сервер Huawei XH620 [ 2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 256Gb RAM ] (2017г)
  7. Сервер Huawei XH620 [ 2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb RAM ] (2017г)
  8. Сервер Huawei XH620 [ 2 x Xeon CPU E5-2690 v4; 128Gb RAM ] (2017г)

Высокопроизводительная вычислительная система (2020г):

Вычислительные ноды: [AMD7452 x 2, 256Gb DDR4, SAS HDD 300Gb x 2, MX 100G EDR] x 13

Вычислительная нода с GPU: [Xeon 8268 x 2, 512Gb DDR4, AS HDD 300Gb x 2, MX 100G EDR, nv tesla T4 -E3-16Gb x 4] x 1

Вычислительная нода: [AMD7452 x 2, 128Gb DDR4, SAS HDD 300Gb x 2, MX 100G EDR] x 1

Вычислительная нода: [AMD7742 x 2, 2Tb DDR4, SAS HDD 300Gb x 2, MX 100G EDR] x 1

Вычислительные ноды: [AMD7742 x 2, 1Tb DDR4, SAS HDD 300Gb x 2, MX 100G EDR] x 4

Система бесперебойного питания в составе: ИБП Huawei UPS5000-E 25kVa с резервированием N+1. Резервная система питания в составе дизель генераторной установки мощностью 100 кВт.

Система климат-контроля в составе двух промышленных кондиционеров канального типа Kentatsu, мощностью 22.5 кВт каждый.

Основная задача, стоящая перед ЦКП «Биоинформатика» — обеспечение вычислительными ресурсами, консультативной, технической и научно-вспомогательной поддержкой деятельность ФИЦ ИЦиГ СО РАН. А именно:

  1. Решение научных задач в области компьютерной геномики, транскриптомики, протеомики, молекулярной динамики, численного моделирования и системной биологии для отдела системной биологии и других научных подразделений ИЦиГ СО РАН
  2. Обеспечение вычислительными ресурсами и доступа к ПО для сотрудников ИЦиГ СО РАН, которые готовы сами обрабатывать данные.
  3. Обеспечение поддержки Web-ресурсов ИЦиГ СО РАН, как созданных отделом системной биологии, так и другими подразделениями.
  4. Разработка и создание баз данных а области биоинформатики
  5. Обеспечение вычислительными ресурсами и тех. поддержкой деятельности административных и вспомогательных подразделений ИЦиГ СО РАН (бухгалтерия, IT-отдел и т.д.)
  6. Обеспечение выполнения больших институтских проектов.
  7. Взаимодействие и сотрудничество с организациями ННЦ (НГУ, ИВМиМГ, ИЯФ, ИВТ) и за его пределами, для обеспечения решения задач ИЦиГ СО РАН в области биоинформатики.
  8. Осуществление поддержки образовательной деятельности, проведение практических курсов при поддержке ЦКП

Логическая организация вычислительных ресурсов ЦОД выглядит следующим образом:

  • Пул серверов для высокопроизводительных вычислений
  • Пул серверов системы хранения.

В свою очередь система хранения подразделяется на:

  • Высоконагруженное оперативное хранилище для высокоскоростного параллельного доступа – обеспечивает поток «горячих» данных для вычислительных программ на сервера HPC.
  • Оперативное хранилище для системы виртуализации — предназначено для развертывания активных образов виртуальных машин
  • Хранилище данных общего назначения – предназначено для хранения «теплых» и «холодных» пользовательских данных, хранения backup – данных.
  • Архивное хранилище на базе ленточных систем – предназначено для хранения данных долговременных неизменяемых архивов.