- Компьютерная геномика;
- Компьютерная транскриптомика;
- Компьютерная протеомика;
- Многомерный анализ биологических данных;
- Математическое моделирование биологических систем и процессов;
- Эволюционная биоинформатика и сравнительный анализ;
- Популяционно-генетический и сегрегационный анализ;
- Моделирование макромолекул методами молекулярной динамики и механики;
- Анализ биологических текстов (text-mining);
- Базы данных и знаний;
- Компьютерное фенотипирование;
- Анализ изображений;