О Центре Коллективного Пользования «Биоинформатика» ИЦиГ СО РАН

Современная биология стала источником беспрецедентно огромных объемов экспериментальных данных. Их осмысление и практическое применение невозможны без привлечения современных информационных технологий, эффективных методов анализа данных и моделирования биологических систем и процессов на различных иерархических уровнях организации живой материи: от молекулярно-генетического, клеточного, организменного до экосистемного и биосферного. В ответ на этот вызов возникла компьютерная системная биология как союз экспериментальных подходов с биоинформатикой.

Основные направления деятельности ЦКП

  1. Создание и поддержка информационной и программно-аппаратной инфраструктуры, объединяющей через специализированные сети передачи данных суперкомпьютерные вычислительные комплексы и объемные хранилища данных с уникальными высокопроизводительными экспериментальными установками для решения задач геномики, протеомики, масс-спектрометрии, микроскопии и томографии.
  2. Компьютерная и информационная поддержка исследований и разработок, выполняемых в рамках программы «Геномика, протеомика, биоинформатика» включая решение следующих задач:
    • обработка первичных данных, получаемых с использованием экспериментальных технологий геномики, протеомики, масс-спектрометрии, микроскопии, томографии;
    • обеспечение доступа к распределенным мировым информационным ресурсам в области геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики, генетики, молекулярной и клеточной биологии, физиологии, фармакологии, биомедицины, биотехнологии и др.;
    • разработка алгоритмов и методов обработки и хранения биологических данных;
    • поддержка высокопроизводительных, параллельных, распределенных вычислений и Web-сервисов в биоинформатике;
    • компьютерное моделирование живых систем на различных уровнях их иерархической организации;
    • планирование экспериментов с использованием методов биоинформатики и системной биологии;
    • разработка новых экспериментально-компьютерных технологий для системной биологии.
  3. Повышение квалификации сотрудников в области компьютерной биологии, биоинформатики и высокопроизводительных вычислений в науках о жизни; подготовка специалистов, владеющих методами биоинформатики, теоретического и компьютерного анализа и моделирования, необходимыми для решения широкого круга фундаментальных и прикладных проблем биологии, физиологии и биомедицины, фармакологии и биотехнологии.

При возникновении новых научных направлений и задач в число учредителей могут быть включены другие организации на основании дополнений к Договору о научно-техническом сотрудничестве в рамках Межинститутского распределенного ЦКП «Биоинформатика».

В рамках деятельности ЦКП предполагаются проведение совместных конференций, семинаров и рабочих совещаний, научных школ, организация стажировок, учебной и научной практики для студентов и аспирантов. О своей деятельности ЦКП отчитывается перед Научно-техническим советом ЦКП, а также представляет отчеты в ученые советы организаций-учредителей, Объединенный ученый совет по биологическим наукам, Объединенный ученый совет СО РАН по нано- технологиям и информационным технологиям, Объединенный ученый совет СО РАН по математике и информатике, совет СО РАН по супервычислениям.

В рамках ЦКП функционируют следующие научно-технологические секции: