Секвенаторы третьего поколения (одномолекулярные) дают длинные чтения (до 40-100 kb длиной), хотя нужно помнить, что медианная длина чтения обычно оказывается в пределах 8-12 kb, и их точность существенно уступает точности NGS-систем. Поэтому оптимальным способом их использования является комбинирование при анализе данных Nanopore и Illumina, что позволяет использовать сильные стороны обеих технологий
В ЦКП имеется одномолекулярный секвенатор Nanopore MK1C, позволяющий решать большинство задач.
- Секвенирование малых геномов (бактерии, грибы, митохондрии), содержацие длинные районы высокогомогенных повторов
- Секвенирование эукариотических геномов для закрытия протяжённых гэпов и разрешения районов повторяющихся последовательностей
- Задачи по вашему выбору – поиск крупных геномных перестроек, анализ транскриптома для изучения вариантов альтернативной транскрипции и т.д.